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Bioinformatica
La medicina molecolare è progredita fino al punto in cui la maggior parte dei geni e delle proteine umani è stata caratterizzata e i metodi numerici sono diventati necessari per capirne meglio la struttura, i meccanismi e le funzioni.
L'obiettivo della bioinformatica è la creazione di nuova conoscenza analizzando i dati genomici, proteomici e trascrittomici, per suggerire nuovi esperimenti che forniscano indizi sulle basi molecolari della vita. I dati generati dai vari progetti di sequenziazione genetica formano la base da cui estrarre informazioni riguardo i moduli e le reti di regolazione e per interpretare i dati genotipici e fenotipici.
Nel mondo entrano in funzione sempre più supercomputer dedicati all'analisi del genoma umane, mentre altri sono in fase di sviluppo.
Algoritmi più efficienti e librerie di strumenti di analisi sempre più ricche stanno cambiando il modo in cui i ricercatori compiono le scoperte biomediche. In questo ambito è chiaramente percepita la necessità di creare robuste piattaforme e di progettare software avanzati di data mining per l'analisi di grandi serie di dati in collaborazione con i ricercatori che generano i dati sperimentali.
Il CILEA è particolarmente attivo in questo campo, essendo partner in importanti progetti:
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(Laboratory for Interdisciplinary Technologies in Bioinformatics). Un laboratorio finanziato dal Ministero dell'Istruzione, dell'Università e della Ricerca (MIUR - Italy) attraverso una borsa FIRB2003 per il periodo dal 2005 al 2010.
Il progetto LITBIO ha lo scopo di fornire alla comunità bioinformatica internazionale risorse di calcolo affidabili, mettendo a disposizione le competenze e le conoscenze del personale CILEA. Por raggiungere gli obiettivi del progetto, è stato installato un supercomputer progettato specificatamente per applicazioni di bioinformatica |
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LV3/CAP/1BL/PRG/ENG/001 |
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Computational Fluid Dynamics (CFD) of racing sailing yachts represents a cutting hedge application field in the marine research technologies. Since 1995 the three-dimensional Navier-Stokes CFD modeling became a complementary tool for any successful design and prototyping . |
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Il CILEA ha iniziato la collaborazione con il gruppo AMS-INFN Milano Bicocca nel 1997, con la responsabilità di installare e gestire l'AMS Data Center, presso il quale sono stati salvati i dati di AMS-01, relativi alle misure di raggi cosmici a bordo dello Space Shuttle STS-91 del 1998. In particolare è stato sviluppato dal CILEA un applicativo in C che, per mezzo delle apposite API, ha popolato in real-time, ricevendo i dati direttamente dal Johnson Space Center della NASA, un DataBase Oracle (8i e in seguito 9i) con tutti i dati raccolti (circa 100 M eventi).
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LV3/CAP/SEP/PRG/ENG/001 |
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SEPAC, South European Partnership for Advanced Computing, è una cooperazione internazionale basata su tecnologie Grid formata da alcuni dei principali centri di calcolo ad alte prestazioni del Sud dell'Europa.
L'obiettivo è costruire un'ambiente per applicazioni grid altamente affidabile basate su tecnologie open source che forniscano un'interfaccia utente potente e facile da usare per scienziati e ricercatori in un ambiente distribuito ed eterogeneo.
SEPAC è aperto a tutti in Centri Europei di Calcolo.
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LV3/CAP/BIO/PRG/ENG/001 - Febbraio 2008 |
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BioinfoGRID (Bioinformatic Grid Application for life science). Un progetto finanziato dall'Unione Europea nell'ambito del Sesto Programma Quadro per lo sviluppo della ricerca e della tecnologia (FP6), come parte del programma specifico "Strutturare l'Area della Ricerca Europea", nell'ambito dell'attività di sviluppo delle
infrastrutture per la ricerca, per il periodo 2006/7.
L'azione specifica di supporto (ASS) BioinfoGRID ha lo scopo di combinare servizi e applicazioni bioinformatiche per utenti di biologia molecolare con le infrastrutture GRID create dal progetto EGEE (Sesto Programma Quadro). In particolare, BioinfoGRID favorisce la collaborazione tra i fornitori europei di infrastrutture di GRID e la comunità dei ricercatori. |
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Chemiadsorbimento e Dinamica Reattiva
La simulazione su computer del chemiadsorbimento su superfici metalliche può offrire un valido aiuto per la comprensione dei diversi aspetti di uno degli stadi fondamentali della catalisi eterogenea. |
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La Dinamica Molecolare di sistemi proteici apre la strada ad una migliore comprensione delle relazioni esistenti fra struttura molecolare e funzionalità biologica di componenti essenziali nei processi vitali.
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La simulazione numerica dei processi di combustione turbolenta costituisce oggi un significativo supporto al progetto e all'ottimizzazione di complessi sistemi nei settori dell'energetica e della propulsione. |
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